Marcin Ziębiński w świecie filmowym obecny jest od najmłodszych lat. Już jako dziecko występował w telewizyjnych serialach „Polskie drogi” i „Czterdziestolatek”. W 1979 r. nakręcił swoje pierwsze filmy amatorskie na taśmie 8mm. W 1983 roku zrealizował na taśmie 16mm krótkometrażowy film „Klucz do….”, nagrodzony na ponad 20 festiwalach krajowych i zagranicznych. W 1984 był asystentem reżysera Piotra Szulkina przy filmie „Ga-ga. Chwała bohaterom”. W trzy lata później został studentem Państwowej Wyższej Szkoły Filmowej, Telewizyjnej i Teatralnej w Łodzi. W czasie studiów wyreżyserował następujące filmy krótkometrażowe: „Zupka“, „Opłatek“, „Playback czyli pamiętnik znaleziony w wannie”, „Bumerang”, „Zatrzymać nagranie”, „Kto zabił moją mamę”, „Wernisaż” – na podstawie sztuki Havla. W 1991 nakręcił swój pierwszy pełnometrażowy kostiumowy film fabularny „Kiedy rozum śpi”, który powstał w koprodukcji polsko-francuskiej. W filmie zagrali Wojciech Pszoniak, Janusz Gajos, Jan Peszek, Ute Lemper, Phillippine Leroy-Beaulieu, Jonathan Zaccai. Film otrzymał w 1992 nagrodę za debiut na festiwalu w San Sebastian, był oficjalnie pokazywany na konkursie festiwalu w Cannes w sekcji „Cinéma en France“. Jako jeden z najlepszych filmów festiwalu w Cannes został pokazany w retrospektywie Valencia’92 i Montreal ’92. Dzięki temu „Kiedy rozum śpi“ otwierał uroczyście festiwal w Viaregio. Na najważniejszym polskim festiwalu filmowym w Gdyni otrzymał nagrodę za najlepszą rolę drugoplanową dla Janusza Gajosa i był nominowany do nagrody za debiut. W tym samym roku Marcin nakręcił trzy, a w rok później dwa odcinki przygodowo-komediowego serialu „Bank nie z tej ziemi”. Równocześnie zaczął realizować pierwsze reklamy w Polsce. W okresie 1993 – 2015 – zrealizował ich ponad 600 specjalizując się w reklamach z celebrytami, farmaceutycznych i z użyciem efektów specjalnych i trudnych technologicznie scenariuszy, dla takich firm jak: Renault, VW, Skoda, Orange, Sony, Panasonic, McDonalds, Lipton, Danon, UPC Zdrowie, Novascon Pharmaceuticals, P&G, PZU i wiele innych. Jednocześnie Marcin zrealizował dwa spektakle w Teatrze Telewizji. Pierwszy z nich – „Trzy szkice miłosne” – powstał na podstawie sztuki Władyslawa Odojewskiego. Drugi „Fernando Krapp napisał do mnie ten list” Tankreda Dorsta – został uznany najlepszym teatrem telewizji roku. W 1995 wyreżyserował również „Pop show” czyli Kabareton na Festiwalu Polskiej Piosenki w Opolu. W 1996 roku ukończył realizację pełnometrażowego thrillera „Gniew” z czołowymi aktorami polskiej kinematografii. W 1997 zrealizował teatr telewizji „Spór” na podstawie sztuki Marivaux z Andrzejem Sewerynem, Grażyną Szapołowską, Jolantą Fraszyńską, Gabrielą Kownacką i Rafałem Maćkowiakiem. W 2001 roku wyreżyserował film telewizyjny „Siedem dalekich rejsów” według powieści Leopolda Tyrmanda z Agnieszką Warchulską, Krzysztofem Pieczyńskim i Anną Dymną. Zrealizował także teledysk polskiej gwiazdy piosenki – Kayah – „Jaka ja Kayah jestem”, który otrzymał „Drewnianego Yacha” na IX Festwalu Teledysków, i nominację do Fryderyków w tym samym roku. W 2002 rozpoczął prace nad wysokobudżetowym, niezależnym filmem akcji – „Dublerzy” z takimi gwiazdami jak Andrzej Grabowski, Robert Gonera, Zbigniew Zamachowski, Krystyna Feldman, Marek Perepeczko. Film ostatecznie na ekranach ukazał się w 2006 stając się drugim wakacyjnym hitem lata po „Piratach z Karaibów“.
Od 2012 r. Marcin przygotowuje produkcję fantasy „The Year of Prophecy” na podstawie powieści Doroty Terakowskiej „Córka Czarownic”.
